De facto o Dark_Sorcerer tem razão!
Aqui http://forum.xda-dev...d.php?t=2090826 são apontados alguns dos motivos.
Voltei a colocar o meu Nexus 7 em stock mas sem root nem é a mesma coisa.
Depois tive que voltar para CM 10.1 pois é a ROM que mais se adequa as minhas necessidades.
Agora que já passou algum tempo posso tentar explicar o que penso que estava a acontecer com o meu Nexus 7.
Embora ele indicasse 30% de bateria, já deveria estar sem bateria alguma. O que significa que mesmo quando marcava 100% estaria abaixo disso.
Seguindo algumas dicas do XDA, fiz o seguinte.
1. Deixei-o desligar-se sozinho aos 30%
2. Mantive-o desligado varias horas.
3. Com o carregador liguei apenas para ver o simbolo da bateria (em off). Para verificar o nivel de carga.
4. Continuei com ele desligado ate não aparecer qualquer carga.
5. Carreguei totalmente em off.
6. Liguei
7. Usei ate se desligar totalmente, desta vez, já com 1%
8. Carreguei de novo em off.
Fiz o ponto 7 e 8 algumas vezes.
Agora parece estar a funcionar normalmente! Apenas desliga com valores baixos, como 1%.
E tenho feito actualizações de CM normalmente.
O meu receio era ser algum problema de contacto com a bateria.
Visto que o tampa traseira do Nexus 7 não poder ser removida pelo utilizador não queria ficar umas semanas a espera da assistência técnica.
Assim parece estar resolvida a situação.
Caso alguém necessite de enviar o seu para a garantia, este link é bastante util.
http://forum.xda-dev...d.php?t=1907796